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Yerli Marín Tovar
Maestro en ciencias bioquímicas con la tesis "Caracterización del proceso de traducción durante la infección por rotavirus", bajo la dirección de la doctora Susana López, en el Instituto de Biotecnología de la UNAM, trabajo que le permitió adquirir conocimiento y experiencia en técnicas relacionadas con el cultivo de células y la obtención de proteínas recombinantes. Actualmente estudia el Doctorado en Ciencias Bioquímicas desarrollando el proyecto "Ingeniería metabólica y estrategias de cultivo con Escherichia coli para la producción de ácido (R)-3-hidroxibutírico a partir de mezclas de glucosa y xilosa'", bajo la dirección del doctor Alfredo Martínez, en este mismo instituto.
    [toc] => Abstract	13
Resumen   	15
Introducción	17
Rotavirus	 17
Traducción	19
Ribosomas	19
Mecanismo de traducción	21
Complejo eIF4F	22
Proteínas 4E-BPs	23
Complejo ternario	24
Fosfatasa celular PP1	25
Mecanismo de inicio de la traducción	26
1. Planteamiento del problema	29
2. Hipótesis y objetivos	33
3. Materiales y métodos	35
Células, virus y bacterias	35
Determinación de título viral	35
Aislamiento de complejos ribosomales	36
Análisis de complejos ribosomales	37
Electroforesis en gel de agarosa	37
Electroforesis SDS-PAGE	37
Pruebas de Western blot	38
Lisados para determinar probables interacciones con PP1 o NSP2	39
Ensayos de pul-down con las proteínas recombinantes	39
4. Datos y resultados	41
Análisis bioinformático	41
Propiedades fundamentales de las proteínas de rotavirus	41
Características generales de los aminoácidos	42
Motivos relacionados con el proceso de traducción	44
Complejos ribosomales	49
Perfiles ribosomales	49
Análisis de proteínas en los complejos 485 y polisomas	52
Análisis de proteínas en fracciones individuales	55
Análisis comparativo lisados mock con TLPs
purificadas - lisados infectados	58
Análisis de proteínas no estructurales	60
Interacciones entre proteínas virales y la fosfatasa celular PP1	65
Interacciones con GST-PP1	68
Interacciones con GST y GST-PP1	72
Interacciones con PP1-H6 fijada	74
Interacciones con PP1-H6 solubilizada	84
Interacciones con NSP2-H6	87
5. Discusión	97
6. Conclusión	105
7. Perspectivas	 107
Bibliografía	109
Siglas, acrónimos y abreviaturas	111
Anexos	115
1. Secuencias de aminoácidos de las proteínas de la cepa
RRV de rotavirus	 115
2. Propiedades fundamentales de las proteínas de la cepa
RRV de rotavirus	118
3. Clasificación general, códigos y probabilidad de los aminoácidos	 119
4. Propiedades fundamentales de los factores de inicio
de la traducción	120
5. Propiedades fundamentales de proteínas relacionadas con el proceso
de traducción y de otras proteínas mencionadas en este trabajo	122
6. Alineamiento múltiple de secuencias de NSP2 de distintas
cepas de rotavirus	123
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