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Libros UNAM

Develando uno de los misterios de la relación íntima entre rotavirus y la célula.

Develando uno de los misterios de la relación íntima entre rotavirus y la célula. Probable interacción entre la proteína viral NSP2 y la fosfatasa celular PP1 durante la infección por rotavirus

 

ISBN: 9786070288470

Autor(es): Yerli Marín Tovar

Editor/Coeditor/Dependencia Participante: Coordinación de Estudios de Posgrado

Formato: Libro Impreso

Disponibilidad: En existencias

Special Price MXN$350

Precio Habitual: MXN$500

ISBN/ISSN 9786070288470
Entidad Académica Coordinación de Estudios de Posgrado
Edición o Número de Reimpresión 1a edición, año de edición -2016-
Tema Química
Número de páginas 124
Tamaño 21 x 14 x 0.7
Terminado o acabado rústico
Idioma español
Contenido Abstract 13
Resumen 15
Introducción 17
Rotavirus 17
Traducción 19
Ribosomas 19
Mecanismo de traducción 21
Complejo eIF4F 22
Proteínas 4E-BPs 23
Complejo ternario 24
Fosfatasa celular PP1 25
Mecanismo de inicio de la traducción 26
1. Planteamiento del problema 29
2. Hipótesis y objetivos 33
3. Materiales y métodos 35
Células, virus y bacterias 35
Determinación de título viral 35
Aislamiento de complejos ribosomales 36
Análisis de complejos ribosomales 37
Electroforesis en gel de agarosa 37
Electroforesis SDS-PAGE 37
Pruebas de Western blot 38
Lisados para determinar probables interacciones con PP1 o NSP2 39
Ensayos de pul-down con las proteínas recombinantes 39
4. Datos y resultados 41
Análisis bioinformático 41
Propiedades fundamentales de las proteínas de rotavirus 41
Características generales de los aminoácidos 42
Motivos relacionados con el proceso de traducción 44
Complejos ribosomales 49
Perfiles ribosomales 49
Análisis de proteínas en los complejos 485 y polisomas 52
Análisis de proteínas en fracciones individuales 55
Análisis comparativo lisados mock con TLPs
purificadas - lisados infectados 58
Análisis de proteínas no estructurales 60
Interacciones entre proteínas virales y la fosfatasa celular PP1 65
Interacciones con GST-PP1 68
Interacciones con GST y GST-PP1 72
Interacciones con PP1-H6 fijada 74
Interacciones con PP1-H6 solubilizada 84
Interacciones con NSP2-H6 87
5. Discusión 97
6. Conclusión 105
7. Perspectivas 107
Bibliografía 109
Siglas, acrónimos y abreviaturas 111
Anexos 115
1. Secuencias de aminoácidos de las proteínas de la cepa
RRV de rotavirus 115
2. Propiedades fundamentales de las proteínas de la cepa
RRV de rotavirus 118
3. Clasificación general, códigos y probabilidad de los aminoácidos 119
4. Propiedades fundamentales de los factores de inicio
de la traducción 120
5. Propiedades fundamentales de proteínas relacionadas con el proceso
de traducción y de otras proteínas mencionadas en este trabajo 122
6. Alineamiento múltiple de secuencias de NSP2 de distintas
cepas de rotavirus 123

Detalles

El libro presenta la interacción de proteínas virales con proteínas celulares involucradas en la regulación de la síntesis de proteínas durante el ciclo replicativo de rotavirus, se estudió por medio de la búsqueda de motivos relacionados con el proceso de traducción mediante análisis bioinformático, seguida del aislamiento de complejos ribosomales por gradiente de sacarosa y su análisis mediante Western blot. Así como un análisis in silico de la secuencia de aminoácidos de la proteína viral NSP2 que permitió identificar dos motivos de interacción con la fosfatasa celular PP1 altamente conservados y las pruebas de Western blot revelaron la presencia de NSP2 y PP I en los complejos ribosomales 48S y 80S de células infectadas. Los ensayos de pull-down permitieron confirmar que estas proteínas interactúan in vitro, lo cual sugiere que es muy probable que también lo hagan in vivo, un resultado muy interesante dado que deja abierta la posibilidad de que NSP2 pudiese ser una subunidad regulatoria de PP1 con función aún desconocida.

Yerli Marín Tovar

Maestro en ciencias bioquímicas con la tesis "Caracterización del proceso de traducción durante la infección por rotavirus", bajo la dirección de la doctora Susana López, en el Instituto de Biotecnología de la UNAM, trabajo que le permitió adquirir conocimiento y experiencia en técnicas relacionadas con el cultivo de células y la obtención de proteínas recombinantes. Actualmente estudia el Doctorado en Ciencias Bioquímicas desarrollando el proyecto "Ingeniería metabólica y estrategias de cultivo con Escherichia coli para la producción de ácido (R)-3-hidroxibutírico a partir de mezclas de glucosa y xilosa'", bajo la dirección del doctor Alfredo Martínez, en este mismo instituto.

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Develando uno de los misterios de la relación íntima entre rotavirus y la célula. Probable interacción entre la proteína viral NSP2 y la fosfatasa celular PP1 durante la infección por rotavirus

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